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Principal Investigator

赵方庆(研究员)

Fangqing Zhao(PI)

赵方庆,“百人计划”研究员、优青基金获得者。2001年获青岛海洋大学海洋生物学、计算机技术及其应用专业学士学位。2006年获中国科学院海洋研究所博士学位,研究方向为海洋生物基因组学。在此期间获得了中国科学院院长特别奖(2006),中国科学院优秀博士论文(2007),国家海洋科学技术奖一等奖(2012)。2006年月至2010年底在美国宾州州立大学比较基因组学和生物信息学研究中心,从事计算生物学和基因组学的研究工作。2010年10月被中国科学院北京生命科学研究院聘为“百人计划”研究员,研究方向为计算基因组学。 现为中科院北京生命科学研究院科研部副主任、技术平台主任、计算生物学联合研究中心秘书长,中国生物工程学会计算生物生物学与生物信息学专委会副主任、副秘书长,Briefings in Bioinformatics, GPB, BMC Evolutionary Biology, Hereditas等国际SCI刊物编委。2012年获得中国科学院“科技创新交叉与合作团队”计划的资助,成立了“计算基因组学”交叉合作团队。近年来,一直围绕着非编码RNA和宏基因组学等科学问题开展研究工作,先后主持国家自然科学基金6项(青年、面上、培育、重点和优青项目)、国家重点研发计划课题、国防科技创新特区课题、中科院知识创新工程资助课题和中科院院长特别奖基金等各1项。近年来,围绕着“计算基因学”研究方向,建立了一系列原创性的生物信息学算法和工具,并在环形非编码RNA和微生物组领域取得重要进展。以通讯作者在Nature Communications、Gut、Genome Biology、Trends in Genetics、Current Biology和Nucleic Acids Res 等国际学术刊物上发表通讯作者研究论文近30篇,平均影响因子超过9;研究论文总引用次数超过3800次,H-index 32,其中多篇论文入选ESI高被引论文;参与编写中英文专著4部。

Fangqing Zhao received his PhD in marine genomics from Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences. The focus of his PhD research was in marine microbial genomics, specifically the evolutionary genomics of photosynthesis in marine microorganisms. In 2006, Dr. Zhao conducted his Postdoc research in the Department of Biochemistry and Molecular Biology at Pennsylvania State University. In 2008, he was appointed as a research associate at Center for Comparative Genomics and Bioinformatics in the same university. At the end of 2010, he was appointed as a Principal Investigator by Beijing Institutes of Life Science, Chinese Academy of Sciences. He published more than 50 research papers in high-profile journals including Nature, Nature Communications, PNAS, Genome Research, Genome Biology & Nucleic Acids Research.

Lab Manager

王金锋

副研究员,人体微生物组学

Jinfeng Wang

Human microbiome & metagenomics

冀培丰

助理研究员,非编码RNA与计算生物学

Peifeng Ji

Noncoding RNA & computational biology

Graduate Student

彭公信

计算生物学

Gongxin Peng

computational biology

史文聿

生物信息学

Wenyu Shi

Bioinformatics

周琳

生物信息学

Lin Zhou

Bioinformatics

郑毅

基因组学

Yi Zheng

Genomics

陈帅

基因组学

Shuai Chen

Genomics

Guest member

何明

中科院大学,纤毛虫基因组学

Ming He

UCAS , Ciliate genomics

Collaborators

戚继 (复旦大学 ) Ji Qi (Fudan University )

苗苗 (中国科学院大学 ) Miao Miao (University of Chinese Academy of Sciences )

吴金雨 (中国科学院北京生命科学研究院 ) Jinyu Wu (Beijing Institutes of Life Science, Chinese Academy of Sciences )